Un groupe de huit jeunes se retrouve seul avec un étranger nommé "Lowe" qui prétend être leur ami d'enfance mais personne ne s'en souvient. Ils viennent également de découvrir qu'ils sont piégés dans un monde où le temps semble figé et où il ne reste qu'un message mystérieux - "Je suis mort. Qui m'a tué ?", laissant le groupe sans autre choix que de trouver ce "tueur" dans une ville déserte. Une liste de suspects peut automatiquement apparaître devant eux, la liste se lit comme suit : Kyosuke Sakurai (le protagoniste), Karen Nikaido (une fille mystérieuse), Yuria Togoku (un physicien de génie), Yu Momono (l'ami le plus proche de Kyosuke), Sai Kamiya (un individu ressemblant à un leader), Ai Morozumi (un disciple de Kamiya), Sota Machikoji (un optimiste insouciant) et Tetsu Kageyama (un observateur timide). Curieusement, Lowe (pas de nom de famille) n'est pas un suspect. Il est juste là pour une raison quelconque. Il suivra tout ce qui se passe de manière déraisonnable. Quant aux suspects qui disparaissent mystérieusement, leurs noms seront rayés, en commençant par Yuria, un par un, ils disparaîtront sans laisser de trace comme dans le monde réel. Tout le monde essaie de trouver des indices et un moyen de sortir du monde de Chronos après que Yuria ait expliqué ce qu'est le monde de Chronos à partir des recherches de sa sœur sur les disparitions de plusieurs familles au Japon, comme l'incident de Balashikha : Un garçon de 13 ans et sa mère disparaissent de manière anormale en 1988 en Rusie sans laisser de traces et sans aucune piste. Après un an, ils ont retrouvé le garçon dans une forêt voisine, cependant, le même "garçon" a vieilli et est devenu un vieil homme d'une soixantaine d'années selon un test ADN. Il ne connaissait plus son propre âge. D'après ses déclarations, sa mère et lui étaient apparemment coincés dans la ville sans personne d'autre et ils étaient incapables de percer un mur de miroir qui les confine dans la ville quoi qu'il arrive. Pendant cinquante ans, ils restent piégés dans la ville déserte jusqu'à ce que ce qui déclenche l'effondrement du monde de Chronos soit la mort de sa mère. Le but est d'atteindre un objectif afin que le monde de Chronos se brise.