Mike Stonebraker, un pionier respecté des bases de données, inventeur d'Ingres, architecte de Postgres et professeur en informatique à l'université du Wisconsin ainsi que son collègue ont osé l'impardonnable, critiquer la base de données de Google et son MapReduce.

Lui et son collègue donc, David DeWitt, ont critiqué la technique et la volonté de la faire entrer dans le cursus académique. La technique du MapReduce manque de certaines fonctionnalités de management des bases de données et est incompatible avec tous les outils dont dépendent les utilisateurs de base de données. La technique ignore pour eux plus de 25 années de technologies en base de données.

La technique, qui permet à Google d'analyser ses énormes flux de données sur ses clusters a pourtant de nombreux défenseurs et ils sont sous le feu de quelques fanatiques sur leur blog à propos de MapReduce.