Cyanogen a annoncé la signature d'un partenariat avec Microsoft, afin d'intégrer nativement plusieurs applications de façon native dans Cyanogen Mod, notamment Skype, OneDrive, Outlook, Microsoft Office, Bing et OneNote. Les constructeurs qui choisiront d'installer sur leurs smartphones cette version alternative d'Android auront donc ces logiciels pré-installées, comme c'est déjà le cas par exemple sur le Galaxy S6 de Samsung.