Je dirais que le danger est plutôt d'ordre backupien: un moment il était de bon ton de dire que les disques durs se vautraient parce qu'il y a l'OS qui tourne dessus (donc plus d'usure), et que donc il est bien d'avoir ses données hors disque système (donc en externe s'il n'y a pas la place en interne).
Sauf que ça ne fait que déplacer le problème: si ce disque externe se plante aussi (d'ailleurs s'il bouge souvent il y a d'autant plus de risque), les données seront perdues aussi.
Quelque soit le disque sur lequel on travail, il est donc judicieux d'avoir un backup.
Miser uniquement sur un disque externe n'est qu'une illusion de sécurité.

Mais ça vous le saviez déjà