La journalisation n'a rien à voir.
J'ai un laptop avec ext3 ou reiserfs, je ne sais plus, et laptop-mode configuré pour monter les FS en noatime, cacher les écritures pendant x minutes avant de redémarrer le disque, etc.

Le atime est une raison de redémarrage régulier du disque, mais cron qui tourne toutes les minutes en est une autre, et chaque programme qui log un event a cet effet aussi.

Pour ma part laptop-mode s'occupe de tout

Et le software suspend, je l'utilise aussi sur ce laptop parce que le support hibernation ACPI pour linux n'est pas top. Mais l'auto-wakeup, je n'ai jamais entendu parler (à part sortir du standby avec un wake-on-LAN)