Oui un machin dans ce genre-là:
http://www.adgvalve.com/produit-fr-26-filtre-y.html
On trouve ça partout. Filtres chimiques et osmose inverse, si tu ne comptes pas boire ton eau de pluie, ça me semble un peu superflu, mais je ne veux pas décourager de bien faire, non plus.
En revanche un filtre à tamis est indispensable, ne serait-ce que pour la pompe elle-même. La crépine qui plonge dans la citerne laisse passer beaucoup trop de crasses.
Pour les chasses d'eau et la machine à laver, si vous êtes deux à la maison et si vous chiez chez votre patron durant la semaine, 3000 litres, c'est déjà pas si mal mais il vaut mieux prévoir un système de type by-pass entre les deux circuits pour les périodes sèches(avec l'anti-retour sur ton compteur et une vanne à chaque bout du by-pass, il n'y a aucun risque que tu envoies jamais de ta sale eau de pluie dans le circuit de distribution )