Si la version 3.0.1 d'Open Office a été rendue plus accessible, certains experts en sécurité ont découvert que l'application embarque un ancien environnement d'exécution Java 6 Update 7 qui peut servir de point d'entrée à des attaques malveillantes. Des utilisateurs malintentionnées pourraient se servir de cette version de Java, via un service ou une application Internet l'invoquant, pour tirer partie de vulnérabilités bien connues et contrôler tout ou partie de plusieurs processus système.

Pour contourner ce problème, il est recommandé d'installer une version récente de Java, Java 6 Update 11 ou 12 (cette dernière dispose d'ailleurs d'une fonctionnalité permettant d'effacer totalement les anciennes versions installées sur le PC).