Il y a des centaines d'années, les ancêtres vivaient dans une certain zénitude, protégés par le pouvoir sacré de deux cristaux. Un cristal maintenait en équilibre le monde spirituel, et l'autre améliorait le monde matériel. Cependant, un traître vola un jour les cristaux afin de devenir un Dieu. Cependant, les précurseurs réussirent à récupérer les cristaux et les brisa en de nombreux fragments afin que de mauvaises mains ne puissent s'en accaparer. Des siècles ont passé et le monde a oublié cette histoire mais une entité maléfique entend désormais attaqué la planète. Il est donc temps pour les descendants des gardiens du savoir de rassembler les fragments de cristal pour stopper le mal. Knowledge Keeper se présente comme un jeu à l'apparence rétro avec une apparence pixel art. Les stages sont assez variés, tout comme la musique. Les commandes s'avèrent quant à elles relativement simple : Vous déplacez le personnage avec le stick analogique gauche (ou la croix directionnelle) et votre seul objectif est de récupérer le cristal dans chaque stage.