Bon, on va tenter de repondre a la question de maniere assez generique. Je suis licensie en informatique, a l'ULB, donc mon appreciation peut quelque peu differer des etudes dispensees a l'ULG.

La license, pardon, la maitrise en informatique t'offre une formation assez generique sur tout l'aspect "logiciel" de l'informatique: algorithmique, programmation procederale/objet/systeme, interface homme machine, base de donnees, reseaux, methodes de conception (UML, Merise, ...). A cela vient s'ajouter une bonne couche de math et de physique, essentiellement electronique, histoire de voir un peu avec quoi on joue. Ensuite, il fout ajouter une (petite) specialisation, que ce soit dans les reseaux, la gestion des ressources (humaines egalement), materiel, systeme, ... suivant ce que ton unif propose.

L'ingenieur civil, lui, a plus une formation basee sur le cote materiel de la machine (processeur, reseau, telecom, ...) couplee a une formation de gestion de projet et de developpement (quoiqu'a l'ULB, cette partie laisse grandement a desirer...).

En general, une serie de cours sont (partiellement) communs aux deux: reseaux, physique, methodes de developpement, et suivant les specialisations.

Maintenant, vu tes ambitions, voici ce que ses formations ne t'apporteront pas:
- une quelconque connaissance dans le developpement de sites web. Seuls tes notions de programmations pourront t'aider a t'orienter.
- une formation a la creation d'une entreprise. Ce n'est pas le petit cour de comptabilite que j'ai eu qui pourrait m'aider a connaitre les lois en vigueur, les status dispos, les demarches a faire, etc... (Zion confirmera surement)
- une connaissance suffisante pour programmer comme un dieu. L'enseignement universitaire est cense, comme son nom l'indique, etre universel. On ne t'apprendra donc pas a maitriser un langage, mais a connaitre des concepts et etre capable de trouver comment les appliquer. L'apprentissage en proffondeur d'un langage, tu devras le faire par toi-meme.

Voila, j'espere que cela t'aidera.

PS: ah. oui. encore un detail. En choisissant de creer une boite, tu ne prends pas la solution de facilite, surtout dans le domaine du web qui est deja fort fort sature.